生殖器疱疹的病原体是单纯疱疹病毒（Herpessimplexvirus，HSV）。单纯疱疹病毒，是一种DNA病毒，人类是单纯疱疹病毒的唯一自然宿主。单纯疱疹病毒可分为Ⅰ型（HSV-1）及Ⅱ型（HSV-2）两种。两者的抗原性不同，即说明它们的结构不同，所产生的抗体也是不同的，所以患口角疱疹的患者并不能对生殖器疱疹有免疫性。HSV-1主要引起口唇部疱疹（俗称热疮），然而HSV-2主要引起生殖器疱疹，但两者也可交叉。90％的生殖器疱疹病。
生殖器疱疹主要传播途径是与生殖器疱疹患者发生性接触，但有疱疹史而无症状的带菌者也是传染源。在成人中，生殖器疱疹病毒抗体的阳性率较高。一般约为10-70%，主要是随着社会经济地位和性生活的情况而变动的。有一项调查表明，在社会经济地位比较低的妇女中，阴道内生殖器疱疹病毒的排出率为0。4-1。33%。有人对一组妓女做生殖道检查时发现，生殖器疱疹病毒的排出率竟高达12%，70%的妓女带有生殖器疱疹病毒。可见生殖器疱疹的发生与性接触有明显的关系。
本病传染性极强，凡与患有阴茎疱疹的男性发生一次性接触的女性，约有60-80%可受感染。本病危害性严重，复发率高，尚可引起女性不孕，流产或新生儿死亡。目前，许多学者还认为子宫颈癌和阴茎癌的发病与生殖器疱疹病毒感染有密切关系，因而引起了人们极大的重视。
生殖器疱疹的基本特点是一旦染病，周期发生，缠绵不愈，而且它可引起不孕、不育，死胎、畸胎。原发感染后经过一定的静止期后常复发，引起复发的原因是发热、月经来潮、劳累、精神紧张、精神创伤及外感等。食物及药物也可能成为诱因。
